git worktree を利用していると git-commit-id-maven-plugin でエラー

…​になりました。

コマンドライン引数でスキップさせるには、 #278 で導入された maven.gitcommitid.skip オプション(現時点最新版の該当コードリンク)を利用して、

などとすれば良さそうです。